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Bothrops N-glycome

ABSTRACT: Laborat�rio Especial de Toxinologia Aplicada CeTICS /Cepid/Instituto Butantan

INSTRUMENT(S): LTQ

ORGANISM(S): Bothrops Cotiara (ncbitaxon:8727) Bothrops Alcatraz (ncbitaxon:320549) Bothrops Jararacussu (ncbitaxon:8726) Bothrops Insularis (ncbitaxon:8723) Bothrops Neuwiedi (ncbitaxon:95648) Bothrops Erythromelas (ncbitaxon:44710) Bothrops Jararaca (ncbitaxon:8724) Bothrops Moojeni (ncbitaxon:98334)

SUBMITTER: Solange M T Serrano

PROVIDER: MSV000081579 | MassIVE | Wed Oct 04 09:06:00 BST 2017

REPOSITORIES: MassIVE

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Project description:Primary objectives: De la 1ère partie de l’étude (Phase I) :- Définir la dose recommandée d’irinotécan selon un schéma d’administration bimensuel en association avec une dose fixe de sorafénib De la 2ème partie de l’étude (Phase II) : - Principal : - Evaluer le taux de contrôle de la maladie (disease control) chez des patients atteints de cancer colorectal métastatique ayant une mutation de KRAS - Secondaires : Evaluer la toxicité, la survie sans progression et la survie globale Primary endpoints: PHASE I : L’escalade de dose est réalisée selon la méthode standard avec au moins 3 patients à chaque palier et un maximum de 6 patients en cas de toxicité limitante. Le nombre minimum de patients est de 3 et le maximum est de 18. En cas d’association irinotécan : 125 mg/m2 + sorafénib : 400 mg deux fois par jour, responsable d’une toxicité limitante, l’essai serait stoppé. Définition de la toxicité dose limitante (DLT)- Toxicité hématologique : grade 4 (granulocytes < 500/mm3, plaquettes < 50 000/mm3) > 7 jours, neutropénie fébrile (fièvre > 38°5 C avec neutropénie de grade 3-4), sepsis concomitant d’une neutropénie de grade 3-4, thrombopénie symptomatique (hémorragie).- Diarrhée grade 4.- Toute toxicité de grade 4 (à l’exception des vomissements en l’absence de traitement préventif ou de l’alopécie).- Toute toxicité nécessitant un retard de cure de plus de 15 jours Définition de la dose maximale tolérée (DMT)La DMT est atteinte si 33% des patients ont au moins une DLT au cours des 3 premières cures de traitement (1,5 cycle). PHASE II : L’objectif principal de l’étude de phase II est le taux de contrôle de la maladie (disease control) défini comme un taux de réponse objective ou une stabilité. - Si le taux de contrôle de la maladie est de 20 % ou moins, l’association expérimentale serait considérée comme inefficace - Si le taux de contrôle de la maladie est de 40 % ou plus, le régime pourrait être considéré comme prometteur. Le plan expérimental de l’étude est un plan de Simon à deux étapes selon un design mini-max (alpha = 10 % ; 1.-beta = 95 %).Un total de 45 patients évaluables est nécessaire à l’inclusion avec une 1ère analyse après 21 patients. A la fin de la 1ère étape (21 patients) : - Si on observe moins de 4 contrôles de la maladie (3 ou moins), l’association expérimentale sera considérée comme inactive et l’essai sera stoppé. - Dans le cas contraire, l’étude sera poursuivie par l’inclusion de 24 patients supplémentaires. A la fin de la 2ème étape: - Si on observe moins de 14 contrôles de la maladie (13 ou moins), le protocole sera considéré comme insuffisamment actif. - Si on observe au moins 14 contrôles de la maladie, le protocole sera considéré comme prometteur. Le Comité de Surveillance de l’essai pourrait considérer d’arrêter les inclusions s’il considère que le taux de toxicités sévères est trop important par rapport à ce qui est attendu dans cette association et dans le cas où l’ensemble des données provenant de sources extérieures à l’essai sont suffisamment convaincant pour influencer les pratiques thérapeutiques. Il en sera de même pour la validation de l’efficacité en phase II. Un plan d’analyse statistique détaillé sera rédigé avant le gel de la base. Le taux de contrôle de la maladie sera calculé avec un intervalle de confiance à 95 % sur l’ensemble des patients inclus et selon l’administration en 2ème ou 3ème ligne de traitement.Les patients inclus en phase I et traités avec une dose sélectionnée d’irinotécan seront inclus dans cette analyse.

Project description:Background: Studies recently support that non-HLA antigens could be additional targets of injury in organ transplant recipients, and MICA was associated with an increased risk of graft loss. Methods: A ProtoArray platform was used to study 37 serum samples from 22 unique patients (15 renal recipients and 7 healthy controls). Thirty paired pre- and post-transplant serum samples were analyzed for detection of de novo post-transplant antibody responses in the 15 patients (10 acute rejection (AR), 5 Stable). Probes on ProtoArray and cDNA platforms (GSE: 3931) were re-annotated and compartment specific gene lists were analyzed using the integrated genomics method. Normal and transplant kidney IHC were performed for MICA antigen localization. Results: Mean MICA-Ab (antibody) signal intensity was significantly higher in transplant patients compared with healthy controls and de novo MICA-Ab were detected in 73% transplant patients. The mean post-transplant signal intensity of MICA-Ab was the highest in C4d+AR. Detection of MICA-Ab responses did not correlate with time post-transplantation, but significantly correlated with decline in graft function over the subsequent year. Integrative genomics predicted localization of the MICA antigen to the glomerulus. IHC confirmed cytoplasmic MICA staining solely in glomerular podocytes in normal kidney. In the transplant kidney, infiltrating mononuclear lymphocytes (T, B and NK) in AR had additional MICA staining. Conclusions: MICA can be highly detected regardless of graft dysfunction or AR. The intensity signal of the MICA antibody correlates with subsequent decline in graft function. The MICA antigen localizes to the glomerulus and infiltrating mononuclear cells in AR. Pre- and post-transplant serum antibodies were profiled for each patient, using the Invitrogen ProtoArrayÂ® Human Protein Microarray v3.0 platform (Invitrogen, Carlsbad, CA). This platform contains 5,056 non-redundant human proteins expressed in a baculovirus system, purified from insect cells and printed in duplicate onto a nitrocellulose-coated glass slide. Each protein is spotted twice on each array, to measure the quality of the signal intensity. Details for experiment processing and analysis follow the previous publication from our group (13). Prospector software was used to retrieve the expression based on immune response profiling of the .gal files.

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