DeNovo Peptide Identification Deep Learning Training Set

ABSTRACT: A benchmark set of bottom-up proteomics data for training deep learning networks. It has data from 51 organisms and includes nearly 1 million peptides.

INSTRUMENT(S): Q Exactive

ORGANISM(S): Legionella Pneumophila (ncbitaxon:446) [cellvibrio] Gilvus Atcc 13127 (ncbitaxon:593907) Delftia Acidovorans Sph-1 (ncbitaxon:398578) Ruminococcus Gnavus Atcc 29149 (ncbitaxon:411470) Micrococcus Luteus (ncbitaxon:1270) Bifidobacterium Bifidum Dsm 20456 = Jcm 1255 (ncbitaxon:500634) Coprococcus Comes Atcc 27758 (ncbitaxon:470146) Erythrobacter Sp. Hl-111 (ncbitaxon:1798193) Synechococcus Elongatus Pcc 7942 (ncbitaxon:1140) Cupriavidus Necator N-1 (ncbitaxon:1042878) Bacillus Subtilis Subsp. Subtilis Str. 168 (ncbitaxon:224308) Bifidobacterium Longum Subsp. Infantis Atcc 15697 = Jcm 1222 (ncbitaxon:391904) Cyanobacterium Stanieri (ncbitaxon:102235) Lactobacillus Casei Subsp. Casei Atcc 393 (ncbitaxon:219334) Citrobacter Freundii (ncbitaxon:546) Bacteroides Thetaiotaomicron Vpi-5482 (ncbitaxon:226186) Sulfobacillus Thermosulfidooxidans (ncbitaxon:28034) Bacillus Subtilis Subsp. Subtilis Str. Ncib 3610 (ncbitaxon:535026) Anaerococcus Hydrogenalis Dsm 7454 (ncbitaxon:561177) Ncbitaxon:1348584 Rhodococcus Jostii Rha1 (ncbitaxon:101510) Rhodopseudomonas Palustris (ncbitaxon:1076) Mycolicibacterium Smegmatis (ncbitaxon:1772) Faecalibacterium Prausnitzii Sl3/3 (ncbitaxon:657322) Streptomyces Griseorubens (ncbitaxon:66897) Acidiphilium Cryptum Jf-5 (ncbitaxon:349163) Prevotella Ruminicola 23 (ncbitaxon:264731) Paenibacillus Polymyxa Atcc 842 (ncbitaxon:1036171) Streptomyces Sp. (ncbitaxon:1931) Streptococcus Agalactiae (ncbitaxon:1311) Fibrobacter Succinogenes Subsp. Succinogenes S85 (ncbitaxon:59374) Pseudomonas Putida Kt2440 (ncbitaxon:160488) Methylomicrobium Alcaliphilum 20z (ncbitaxon:1091494) Ncbitaxon:1305737 Dorea Formicigenerans (ncbitaxon:39486) Alcaligenes Faecalis (ncbitaxon:511) Roseibaca Calidilacus (ncbitaxon:1666912) Halomonas Sp. (ncbitaxon:1486246) Francisella Novicida U112 (ncbitaxon:401614) Stigmatella Aurantiaca Dw4/3-1 (ncbitaxon:378806) Paracoccus Denitrificans (ncbitaxon:266) Bacillus Cereus Atcc 14579 (ncbitaxon:226900) Bacteroides Fragilis 638r (ncbitaxon:862962) Clostridium Ljungdahlii Dsm 13528 (ncbitaxon:748727) Myxococcus Xanthus Dz2 (ncbitaxon:1198133) Agrobacterium Tumefaciens (ncbitaxon:358) Chryseobacterium Indologenes (ncbitaxon:253) Campylobacter Jejuni (ncbitaxon:197) Shewanella Oneidensis Mr-1 (ncbitaxon:211586) Listeria Monocytogenes 10403s (ncbitaxon:393133)

SUBMITTER: Samuel Payne  

PROVIDER: MSV000083150 | MassIVE | Mon Nov 19 17:21:00 GMT 2018

SECONDARY ACCESSION(S): PXD010000

REPOSITORIES: MassIVE